摘要:
为了获得花斑裸鲤丰富的转录组信息和功能基因，应用IlluminaHiSeqTM2500高通量测序技术对花斑裸鲤肝胰脏、肌肉、脑、和肾混合组织转录组进行测序，获得162235条转录本，进一步拼接得到110231条单基因序列（unigene),平均长度745bp。利用生物信息学方法对所有unigenes与美国国立生物技术信息中心（NCBI)的非冗余蛋白质数据库（Nr)进行相似搜索（E-value≤10_5),结果共有34532个unigenes(31.32%)与数据库中的已知基因同源。此外，GO功能注释将unigene分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类56分支，依据K0G功能注释可分为26个功能组分，依据KEGG代谢通路分析可以分成5大类267小类。通过转录组测序数据及功能注释，进一步了解了更多花斑裸鲤的生物学特性、基因的分子功能、参与的生物过程、所处的代谢途径和信号通路。同时，获得了79条与天然免疫相关的同源序列。
