资源 | IPA： 一个帮你挖掘生物学意义的数据库
生命医药学科服务
IPA（Ingenuity Pathway Analysis，通路分析软件）是一款基于云计算的图形化界面生物信息学软件，能够从生物学通路角度将组学数据进行分析、整合和理解，帮助挖掘实验数据中隐藏的生物学意义，揭秘实验数据的价值。
1适用领域
IPA适用于转录组学、蛋白质组学、代谢组学等大数据分析，也适用于一些产生基因、化学物质列表的小规模实验。
2IPA分析基础-IPKB
IPKB（Ingenuity knowledge Base）是IPA最核心的部分，是一个专业的生物学相互作用和功能注释的数据库，收集了上百万的关于蛋白质，基因，化合物，细胞，组织，药物和疾病之间最直接的相互作用关系信息。
3IPA功能
搜索功能
以“EPOR”搜索为例，可以挖掘：
EPOR有什么功能？
与哪些疾病相关？
与哪些药物相关？
参与哪些经典通路？
EPOR的调控子是什么？
EPOR调控哪些基因表达？
EPOR表达上调或下调，对下游作用分子的影响是什么？是否影响与它相关的疾病或功能？
探索EPO与EPOR之间可能的作用路径
分析功能
高级分析功能
4我校IPA使用
上海交通大学IPA数据库并发用户为1，同时只能一人在线。因此采用“预约申请”方式，需提前向学院联系人预约。详细信息见【阅读原文】。
文字 │ 陈巧梅
美编 │ 仲汇慧
来源 │ 生命医药学科服务
上海交通大学图书馆
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