基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)序列分析瓢鸡的遗传多样性

《云南农业大学学报:自然科学版》 贡潘偏抽[1];刘丽仙[2];李大林[3];袁跃云[3];孙利民[3];杨润[4];刘文瑜[5];刘伟[1];苗永旺[1]
摘要:
采用PCR产物直接测序技术对云南省镇沅县50只瓢鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明:在所分析的D-loop区序列中(520 bp),T,C,A,G平均含量分别为30.4%,29.6%,27.4%,12.6%;共检测到27个核苷酸多态位点,其中24个为转换,3个为颠换,序列突变率为5.19%;序列存在13种单倍型,单倍型多样度(H)为0.883±0.028,核苷酸多样度(π值)为0.015 03±0.000 99,表明瓢鸡群体内遗传变异较丰富。瓢鸡样品可划分为A,B,E,F,G等5个世系,在NJ无根系统树上聚为5大枝,揭示瓢鸡在遗传组成上具有5个母系血统来源。
瓢鸡 , 线粒体DNA , D—loop , 单倍型 , 遗传变异 , 核苷酸多样度
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